Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sft2d3Q9CSV6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms