Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms