Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dis3Q9CSH3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dis3Q9CSH3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 341.2 ms