Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Exosc5Q9CRA8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Exosc5Q9CRA8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms