Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ska2Q9CR46 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ska2Q9CR46 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms