Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PclafQ9CQX4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms