Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ykt6Q9CQW1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.5 ms