Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rer1Q9CQU3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rer1Q9CQU3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms