Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms