Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer1Q9CQL2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms