Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdm1Q9CQK3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rdm1Q9CQK3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms