Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQF4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms