Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab5aQ9CQD1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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