Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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