Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc5Q9CQA1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Trappc5Q9CQA1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc5Q9CQA1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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