Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms