Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpa3Q9CQ71 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpa3Q9CQ71 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpa3Q9CQ71 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms