Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp3Q9CQ10 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp3Q9CQ10 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms