Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV3

Mrpl42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl42Q9CPV3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl42Q9CPV3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl42Q9CPV3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl42Q9CPV3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl42Q9CPV3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms