Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930519G04RikQ9CPT7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930519G04RikQ9CPT7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms