Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rrbp1Q99PL5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rrbp1Q99PL5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms