Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rims1Q99NE5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rims1Q99NE5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms