Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac9Q99N13 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac9Q99N13 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms