Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a4dQ99N05 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms