Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprtQ99M80 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
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