Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms