Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ubxn2aQ99KJ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn2aQ99KJ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms