Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms