Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ufsp2Q99K23 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufsp2Q99K23 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms