Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlcd1Q99JT6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlcd1Q99JT6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlcd1Q99JT6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms