Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg5Q99J83 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg5Q99J83 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms