Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddb2Q99J79 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms