Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn16Q925N4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn16Q925N4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn16Q925N4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn16Q925N4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn16Q925N4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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