Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rtn4ip1Q924D0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4ip1Q924D0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms