Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Neurl1Q923S6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Neurl1Q923S6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms