Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b3Q921M3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms