Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp4Q921I6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp4Q921I6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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