Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EedQ921E6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EedQ921E6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EedQ921E6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EedQ921E6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EedQ921E6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EedQ921E6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms