Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc1bQ920F6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms