Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Afg3l1Q920A7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Afg3l1Q920A7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Afg3l1Q920A7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Afg3l1Q920A7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Afg3l1Q920A7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Afg3l1Q920A7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Afg3l1Q920A7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Afg3l1Q920A7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Afg3l1Q920A7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Afg3l1Q920A7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Afg3l1Q920A7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Afg3l1Q920A7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Afg3l1Q920A7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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