Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Pde6cQ91ZQ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Pde6cQ91ZQ1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Pde6cQ91ZQ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pde6cQ91ZQ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Pde6cQ91ZQ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Pde6cQ91ZQ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Pde6cQ91ZQ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Pde6cQ91ZQ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Pde6cQ91ZQ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Pde6cQ91ZQ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde6cQ91ZQ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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