Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc5a4bQ91ZP4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc5a4bQ91ZP4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms