Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc49Q91YK0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc49Q91YK0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms