Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms