Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhb12Q91Y07 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhb12Q91Y07 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdhb12Q91Y07 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms