Protein–RNA interactions for Protein: Q91XL2

Lnx2, Ligand of Numb protein X 2, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx2Q91XL2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx2Q91XL2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lnx2Q91XL2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms