Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna2Q91X60 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms