Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn8Q91VA3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn8Q91VA3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms