Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ccdc71Q8VEG0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc71Q8VEG0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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