Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc115Q8VE99 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc115Q8VE99 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc115Q8VE99 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc115Q8VE99 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc115Q8VE99 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc115Q8VE99 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc115Q8VE99 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc115Q8VE99 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc115Q8VE99 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc115Q8VE99 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc115Q8VE99 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc115Q8VE99 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms